中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (2): 1-6.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.02.001

• 遗传育种 •    下一篇

肉鸡屠宰性状全基因组关联分析

王一东1,2,陈智武3,黄 超3,粟永春3,余 洋3,崔焕先2,郑麦青2,赵桂苹2,文 杰2,王述柏1*   

  1. (1.青岛农业大学动物科技学院,山东青岛 266109; 2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,动物营养学国家重点实验室,北京 100193; 3.广西金陵农牧集团有限公司,广西南宁 530000)
  • 出版日期:2024-02-15 发布日期:2024-02-22
  • 作者简介:王一东(1997-),男,硕士研究生,研究方向为家禽遗传育种,E-mail:1103357313@qq.com

  • Online:2024-02-15 Published:2024-02-22

摘要: 为研究影响肉鸡屠宰性状选育的主要遗传因素,试验采用全基因组关联分析(Ge? nome-wide association study,GWAS)挖掘与屠宰性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点和候选基因。以264只金陵花鸡终端父系公鸡为试验材料,采集血液 提取DNA,使用全基因组重测序技术获取个体基因型数据,使用PLINK 1.90软件对基因型数据 进行质量控制。对宰前体重、屠体重、半净膛重、全净膛重4个性状进行屠宰测定,使用EXCEL 和 R语言进行正态分布检验和相关性分析。使用 GEMMA软件进行 GWAS分析,定位出显著 的 SNP 位点。使用 SPSS 软件分析屠宰性状的有利基因型。结果显示:屠宰性状均符合正态 分布,相关度在0.96以上。定位到4个显著的SNP位点,注释到一个基因为RAB6A。1和 3号染色 体显著位点 TT 为有利基因型,19号染色体上显著位点 CC 为有利基因型。研究提示:应根据 挖掘到的显著SNPs和候选基因进行屠宰性状的选择,加强肉鸡屠宰性状分子育种的理论基础 以提高屠宰加工型肉鸡的选择进展。

关键词: 肉鸡;屠宰性状;全基因组关联分析;单核苷酸多态性

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