中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (12): 101-107.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.12.016

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陕西榆林地区鸡蛔虫的单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析

崔巍山1,李中波2*   

  1. (1.榆林职业技术学院,陕西榆林 719000;2.怀化职业技术学院,湖南怀化 418000)
  • 出版日期:2023-12-15 发布日期:2023-12-12
  • 作者简介:崔巍山(1974-),男,硕士,讲师,主要从事动物疾病防控研究,E-mail:595902826@qq.com

  • Online:2023-12-15 Published:2023-12-12

摘要: 为探究陕西榆林地区鸡蛔虫单倍型多态性及遗传分化情况,并阐明其种系发育关系,试验以分离于榆林不同地区的30条鸡蛔虫为样品,采用PCR扩增其线粒体cox1与nad4基因,进行单倍型多态性、遗传分化与种系发育关系分析。结果显示:在所有的cox1基因(953 bp)序列中,共含30个变异位点(4个转换、26个颠换),17个单倍型(h=17,Hd=0.936),其基因分化系数(Gst)为-0.012 85,遗传分化系数(Fst)为-0.029 95,基因流(Nm)为11.53;在所有的nad4基因(876 bp)序列中,共含29个变异位点(2个转换、27个颠换),16个单倍型(h=16,Hd=0.935 6),其Gst为-0.012 38,Fst为-0.040 9,Nm为17.05;在所有的cox1+nad4基因(1 829 bp)序列中,共含59个变异位点(6个转换、53个颠换),24个单倍型(h=24,Hd=0.977),其Gst为-0.003 9,Fst为-0.036 5,Nm为14.77;在所有cox1、nad4及cox1+nad4基因的Network图中,均未发现有单倍型聚集成簇的现象,构建的种系发育树中30条鸡蛔虫均聚集于一起,共同形成种系发育树的一个分支。研究表明,分离于陕西榆林地区的30条鸡蛔虫之间虽存在一定程度的基因变异,但其个体及单倍型之间具有较近的亲缘关系,尚未出现遗传分化。

关键词: 鸡蛔虫;cox1;nad4;基因变异;单倍型多态性;遗传分化;种系发育关系

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