中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (5): 39-47.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.05.007

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传染性法氏囊病病毒新型重排毒株GX-NN200111的分离鉴定及遗传进化分析

乔远征1,王威威1,施 俊1,张 燕1,陈金南2,项燕华2,王致远2,何秀苗2,韦 平1*   

  1. (1.广西大学养禽与禽病学研究所,广西南宁 530005;2.广西民族大学海洋与生物技术学院,广西高校微生物与植物资源利用重点实验室,广西南宁 530006)
  • 发布日期:2023-05-22
  • 作者简介:乔远征(1996-),男,硕士研究生,研究方向为禽病防控与病原分子生物学,E-mail:qiaoyuanzheng1996@126.com

  • Published:2023-05-22

摘要: 为明确广西某养殖场疑似传染性法氏囊病病毒(IBDV)感染鸡的病原类型及分子特征,试验通过病毒分离、基因扩增、序列测定、核苷酸同源性分析、系统进化树构建、氨基酸位点变异分析、重组及选择压力分析等方法进行病原研究。结果显示:成功分离一株IBDV新型重排毒株(命名为GX-NN200111),该毒株属最新发现A3B1b基因型;分离株GX-NN200111能够在鸡胚中很好地增殖,表现为鸡胚头、颈、背部皮肤出血;序列分析显示,分离株GX-NN200111vVP2属于超强毒株分支A3,核苷酸相似性为93.7%~97.9%,具有超强毒株特征性氨基酸位点212N、222A、256I和294I;VP1-b属于中国新型变异株分支B1b,核苷酸相似性为95.8%~99.7%,具有中国新型变异株的特征性氨基酸位点240E;重组分析未见有证据证实分离株GX-NN200111存在明显的重组事件,选择压力分析发现分离株GX-NN200111在vVP2和VP1-b中分别存在3个(第205、222、249位)和2个(第331、426位)正选择位点;氨基酸置换熵值分析发现分离株GX-NN200111 在 vVP2 和 VP1-b 中分别存在 10 个(第 213、222、242、249、253、254、256、279、294、299位)和4个(第242、287、390、393位)易突变位点。研究证实,分离株GX-NN200111是首次发现的一种新的重排毒株(A3B1b),其A节段来源于超强毒株、B节段来源于中国新型变异株。 异株。

关键词: IBDV;新型变异株;自然重排;遗传进化;重组;选择压力

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