中国家禽 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (2): 10-18.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2022.02.002

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鸡RIPK2 基因启动子核心区域 及生物信息学分析

马予怡1,杨业新1,李欢2,孙长花2,孙红艳1,3*   

  1. (1.扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009; 2.扬州市职业大学生物与化工工程学院,江苏扬州225012; 3.中国教育部国际农业与农产品安全研究联合实验室,江苏扬州225009)
  • 发布日期:2022-02-21
  • 作者简介:马予怡,本科生,专业方向为动物遗传育种,E-mail:421352524@qq.com

  • Published:2022-02-21

摘要: 为了对前期高通量测序筛选出的抗禽致病性大肠杆菌鸡中高表达RIPK2 基因进 行结构和蛋白功能探析,试验通过PCR技术克隆鸡RIPK2 起始密码子前3 201 bp的启动子区, 构建系列启动子区缺失载体,转染HD11细胞,双荧光素酶试验检测启动子核心区域;5-Azadc、 TSA或5-Azadc和TSA联合处理鸡RIPK2 启动子;并结合生物信息学技术对鸡RIPK2蛋白的理 化性质进行系统分析。结果显示:通过PCR技术成功克隆鸡RIPK2启动子区不同片段,单、双酶 切测序结果准确;-2 300~+38 bp区域是鸡RIPK2基因启动子的基本活性区域,-2 300~-1 839 bp 之间存在AP-1、CEBPA和NFκB等重要正调控元件。用5-Azadc、TSA以及5-Azadc和TSA联 合分别处理鸡RIPK2 启动子,均可提高其转录活性。生物信息学分析表明:鸡RIPK2蛋白在细 胞核中表达;在生物进化进程中物种间保守性一般,禽类中保守性很高;存在自身磷酸化位 点。试验结果为进一步研究鸡RIPK2基因转录调控机制和蛋白功能奠定了基础。

关键词: 鸡RIPK2基因;启动子;5-Azadc;TSA;生物信息学

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