摘要： 为研究新城疫（ND）疫苗接种的青脚麻鸡胸腺组织相关基因与调控通路变化，对无 特定病原体（SPF）的青脚麻鸡人工接种ND疫苗48 h后，取胸腺组织采用Illumina HiSeq 2500高 通量测序技术进行转录组测序，使用TopHat2软件对测序得到的reads序列与鸡（Gallus_gallus-5.0） 的参考基因组比对，筛选出差异表达基因后，在GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析 和聚类分析。结果显示：接种ND疫苗后，共筛选到1 514个差异表达基因，其中1 016个基因 上调，498个基因下调；GO功能分类注释到生物学过程、细胞组成和分子功能数据库中的差异 表达基因分别有823、815和985个，注释到KEGG通路中差异表达基因1 274个，显著富集通路 52个（P<0.05）；在差异基因中筛选出70个与鸡先天免疫相关的基因，并使用STRING构建蛋白 质相互作用网络。研究提示：ND疫苗免疫接种后激活了青脚麻鸡先天免疫相关基因或通路， 改善了体内的抗体水平，对探索鸡的宿主-病原体相互作用具有重要意义，为进一步探究青脚 麻鸡接种ND疫苗后机体免疫应答反应提供了研究基础。

关键词: 新城疫疫苗；高通量RNA测序；转录组；先天免疫；青脚麻鸡

中图分类号: 

• S831.2