摘要： 为分析不同产蛋期金定鸭卵巢组织的SNPs和可变剪接，试验选取开产期和产蛋 高峰期金定鸭各 3 只，对其卵巢转录组进行测序，得到 299 927 852 条高质量序列（Clean reads）。对筛选的SNPs进行了功能统计、位点区域统计和影响统计。功能统计结果显示，开 产期共获得错义突变71 276个、无义突变153个、同义突变共287 148个，产蛋高峰期共获得错 义突变65 620个、无义突变138个、同义突变共269 749个；位点区域统计结果显示，开产期外 显子区域共获得401 030个SNPs、内含子区域共242 685个SNPs，产蛋高峰期外显子区域共获 得362 557个SNPs、内含子区域共219 548个SNPs。影响统计结果显示，开产期共获得3 141个 危害程度高的SNPs，294 815个危害程度低的SNPs和72 772个危害程度中等的SNPs。高产期 共获得2 583个危害程度高的SNPs，276 568个危害程度低的SNPs和67 024个危害程度中等 的SNPs。对开产期与产蛋高峰期进行可变剪接（AS）分类及差异AS分析。结果表明，SE事件 最多涉及到15 419个基因，MXE涉及到1 601个基因，A5SS涉及到1 211个基因，A3SS涉及到 1 740个基因，RI涉及到653个基因。进一步对差异AS进行显著性分析，开产期与产蛋高峰期 显著差异的SE有1 085个基因，MXE有219个，A5SS有199个，A3SS有288个，RI有136个。研 究结果为进一步完善蛋鸭的基因组信息提供基础数据。

关键词: 转录组；金定鸭；卵巢；SNPs；可变剪接

中图分类号: 

• S834