中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (5): 1-11.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.05.001

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鸡胚胎期肌纤维形成相关miRNAs的 筛选与分析

杨朝永,陈若楠,张若彤,孙楠桢,汪家骏,孙 杰*   

  1. (石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832000)
  • 出版日期:2024-05-15 发布日期:2024-05-07
  • 作者简介:杨朝永(1995-),男,硕士研究生,研究方向为动物遗传育种与繁殖,E-mail:1829044926@qq.com

  • Online:2024-05-15 Published:2024-05-07

摘要: 研究旨在挖掘鸡胚胎期肌纤维形成相关miRNAs,为进一步探究miRNA在肌肉发 育过程中的调控机制提供理论基础。研究采集玫瑰冠鸡、科宝鸡胚胎期第8天(E8)和第14天 (E14)腿肌组织进行 HE染色和 small RNA 测序,通过生物信息学分析差异表达 miRNAs,随机 选择 14个差异表达的miRNAs进行荧光定量PCR(qRT-PCR)验证结果的准确性。结果显示,玫 瑰冠鸡、科宝鸡E8的肌纤维直径和横截面积极显著小于E14(P<0.01),E8的肌纤维密度极显著 高于E14(P<0.01)。通过生物信息学分析,在12个测序文库中共鉴定出2 455个已知miRNAs和 329个新的miRNAs,其中在E8和E14(C8T vs C14T_R8T vs R14T)中筛选出499个差异表达miR? NAs。GO富集结果显示,差异miRNA靶基因在细胞迁移、代谢过程、细胞增殖、细胞发育和小 分子结合等GO条目中显著富集。KEGG富集分析发现,大量的靶基因富集到与细胞周转和代 谢相关的信号通路中,同时富集到TGF-β、Notch、Hedgehog、Wnt、FoxO等与肌肉发育相关的信 号通路。miRNA-mRNA联合分析结果表明,miR-3594-3p-APOBEC2、miR-1635-FHL3/MEF2D、 miR-193-3p-HDAC3、miR-1724-PRKAG3、miR-1698-PRKAG3 等互作对可能是调控鸡胚胎期 肌纤维形成和肌肉发育的重要因子。研究表明,鸡胚胎期肌纤维形成受到多种 miRNAs和信 号通路的调控,筛选出miR-3594-3p、miR-1635、miR-193-3p、miR-1724、miR-1698等miRNAs 可能在肌纤维形成过程中发挥重要作用。

关键词: 鸡;胚胎期;肌纤维形成;miRNA

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