中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (9): 14-19.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.09.003

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玉龙雪山乌鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析

柳 岚1*,段 婕2*,胡 瑀1,朱柯源1,和永芳2,和岳琪2,苗永旺1**   

  1. (1.云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明 650201;2.云南省丽江市玉龙纳西族自治县畜牧兽医局,云南丽江 674100)
  • 出版日期:2023-09-15 发布日期:2023-09-15
  • 作者简介:柳岚(1998-),女,硕士研究生,研究方向为畜牧科学,E-mail:1057763822@qq.com;段婕(1966-),女,本科,推广研究员,主要从事畜牧科技推广工作,E-mail:dj6627000@sina.cn

  • Online:2023-09-15 Published:2023-09-15

摘要: 为阐明玉龙雪山乌鸡的遗传背景信息,试验采用线粒体DNA D-loop区序列为遗传标记,对采自核心产区的55只玉龙雪山乌鸡样品进行群体变异检测,并将所得数据与已发表的云南12个地方鸡种数据进行联合分析。结果显示:在所有个体中共检测到25个多态位点,包含单一信息位点 2 个,简约信息位点 23 个,核苷酸替换主要为转换,转换与颠换比为6.40。在该群体中共定义了14种单倍型,其单倍型数多样度为0.867±0.027,核苷酸多样度为0.010 74±0.001 14,群体内平均遗传距离为0.011±0.003。玉龙雪山乌鸡与云南其他地方鸡群体间的平均遗传距离在0.013(宁蒗高原鸡)~0.019(大围山微型鸡)之间,遗传分化系数Fst值在0.078(宁蒗高原鸡)~0.543(兰坪绒毛鸡)之间。在世系组成上,玉龙雪山乌鸡中含有B、E、F和G世系,占比分别为20.00%、3.64%、9.09%和67.27%,总体上玉龙雪山乌鸡群体中云南及周边地区的地方鸡血源在76.36%以上。结果揭示,玉龙雪山乌鸡的遗传多样性相对丰富,与云南其他地方鸡种间存在不同程度的遗传分化,其母系世系组成与云南其他地方鸡有较大差异。

关键词: 玉龙雪山乌鸡;mtDNA D-loop;母系世系;遗传多样性;基因渗入

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