中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (7): 19-27.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.07.003

• 遗传育种 • 上一篇    

鸡增殖型与肥大型软骨细胞差异表达基因筛选

贡继尚1,2,3,李袁飞1,2,3,许继国1,2,3,柴学文1,2,3,马荆鄂1,2,3,杨艳北1,2,3,饶友生1,2,3*   

  1. (1.南昌师范学院,生物技术研究院,江西南昌330032;2.江西省地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌330032;3.中国科学院家禽分子育种技术联合实验室,江西南昌330032)
  • 发布日期:2023-07-27
  • 作者简介:贡继尚(1987-),男,博士,讲师,主要从事畜禽内科学研究,E-mail:gongjishang@126.com

  • Published:2023-07-27

摘要: 为研究家禽软骨细胞分化过程中的差异基因,寻找家禽胫骨软骨发育不良发生的相关基因和通路,研究基于GEO数据库下载家禽软骨细胞分化的基因表达谱芯片数据进行生物信息学分析。结果显示:共筛选出292个差异基因,其中40个上调,252个下调;差异基因的GO富集主要在细胞成分活动的调节、趋化性、细胞间黏附和细胞黏附分子结合等过程,KEGG 信号通路分析主要在ECM 受体相互作用、黏着斑等通路富集;PPI 网络分析筛选出APP、SPP1、TF 和LAMB1 4个核心基因,并结合RT-PCR技术对核心基因进行表达谱验证,与预测的结果一致,均表现在增殖型软骨细胞中表达下调。研究表明,从GEO18568数据中分析筛选出的4个核心基因,在增殖型软骨细胞分化为肥大型软骨细胞过程中均发挥正向调控 作用。

关键词: 鸡;软骨细胞;增殖型;肥大型;差异基因

中图分类号: