摘要: 为研究家禽软骨细胞分化过程中的差异基因,寻找家禽胫骨软骨发育不良发生的相关基因和通路,研究基于GEO数据库下载家禽软骨细胞分化的基因表达谱芯片数据进行生物信息学分析。结果显示:共筛选出292个差异基因,其中40个上调,252个下调;差异基因的GO富集主要在细胞成分活动的调节、趋化性、细胞间黏附和细胞黏附分子结合等过程,KEGG 信号通路分析主要在ECM 受体相互作用、黏着斑等通路富集;PPI 网络分析筛选出APP、SPP1、TF 和LAMB1 4个核心基因,并结合RT-PCR技术对核心基因进行表达谱验证,与预测的结果一致,均表现在增殖型软骨细胞中表达下调。研究表明,从GEO18568数据中分析筛选出的4个核心基因,在增殖型软骨细胞分化为肥大型软骨细胞过程中均发挥正向调控 作用。
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