中国家禽 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (2): 36-42.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2022.02.006

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新型鹅星状病毒荧光定量PCR方法的 建立及应用

马水锋1,2,徐梦璐1,2,吴少鹏1,2,邵红霞1,2,3,钱琨1,2,3,万志敏1,2,3,叶建强1,2,3,4,秦爱建1,2,3,4*   

  1. (1.扬州大学兽医学院教育部禽类预防医学重点实验室,江苏扬州225009; 2.扬州大学兽医学院江苏省动物预防医学重点实验室,江苏扬州225009; 3.江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,江苏扬州225009; 4.扬州大学教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室,江苏扬州225009)
  • 发布日期:2022-02-21
  • 作者简介:马水锋(1981-),男,博士,主要从事兽医学研究,E-mail:sfma@yzu.edu.cn

  • Published:2022-02-21

摘要: :为建立一种准确快速检测新型鹅星状病毒(Goose astrovirus,GAstV)的方法,研究 以GAstV毒株JS20为模板,根据GAstV的ORF2 基因序列设计特异性引物,在构建重组质粒 pGEMT-GAstV的基础上,建立了检测GAstV的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR(qRT-PCR) 方法。结果显示:阳性对照重组质粒pGEMT-GAstV在1.087×101~1.087×108拷贝/μL浓度之间 与qRT-PCR的Ct值呈现良好的线性关系;该qRT-PCR对所检测的鸡星状病毒(cASTV)、禽腺 病毒(FAdV)、小鹅瘟病毒(GPV)以及鸭坦布苏病毒(DTMUV)均无交叉反应;检测灵敏度为 1.087×101拷贝/μL,组内和组间变异系数均小于1.6%。利用该qRT-PCR方法对在鹅胚及LMH 细胞上繁殖不同代次的JS20病毒载量进行检测发现,JS20在鹅胚上的扩增效率更高,病毒载 量可达108~109拷贝/mL。对江苏不同地区26份临床样品进行检测发现,该qRT-PCR方法的阳 性检出率为73.08%,而普通PCR方法阳性检出率仅为42.30%。结果表明建立的新型GAstV qRT-PCR具有很好的特异性及灵敏度,且在新型GAstV定量分析及临床样品检测诊断中展示 了良好的应用前景。

关键词: 新型鹅星状病毒;荧光定量PCR;特异性;灵敏度;临床诊断

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