中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (10): 179-184.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.10.023

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镇坪乌鸡群体遗传多样性及遗传结构分析

任远明1,梁小军2,敖显配3,张睿昕3,邓必俊3,杨丽煜3,朱 瑞3,魏泽辉3*   

  1. (1.陕西省安康市镇坪县畜牧兽医中心,陕西安康 725699; 2.陕西省安康市畜牧兽医中心,陕西安康 725000; 3.西北农林科技大学,陕西杨凌 712100)
  • 出版日期:2024-10-15 发布日期:2024-10-15
  • 作者简介:任远明(1973-),男,学士,高级兽医师,主要从事家禽地方品种繁育及改良研究,E-mail:rym180@qq.com

  • Online:2024-10-15 Published:2024-10-15

摘要: 为了解镇坪乌鸡的群体遗传多样性和遗传结构差异,试验对镇坪乌鸡及国内外9个 品种鸡(略阳乌鸡、红色原鸡、白来航鸡、BRB肉鸡、赤水乌骨鸡、乌蒙乌骨鸡、北京油鸡、丝羽 乌骨鸡和藏黑鸡)的基因组测序数据进行分析,利用基因组核苷酸多态性信息计算观测杂合 度和连锁不平衡衰减距离等评价群体遗传多样性的指标,并通过构建系统发育树,进行群体 遗传分化指数(Fst)、主成分和Admixture分析解析这些品种的群体结构特征。结果显示:镇坪 乌鸡遗传多样性丰富、杂合度较低,连锁不平衡(LD)衰减距离短,衰减速度快;Fst分析结果表 明,不同乌鸡品种之间呈现较低水平的遗传分化,而镇坪乌鸡与非乌鸡品种之间呈现中高水 平的遗传分化;Admixture分析显示,国外品种遗传结构单一,国内地方品种则遗传结构相对复 杂,且可能与国外品种发生过杂交;此外,略阳乌鸡与镇坪乌鸡的遗传结构相似,表明两个品 种可能具有较高的同源性。综上所述,镇坪乌鸡遗传多样性丰富,遗传资源具有巨大的挖掘 潜力,但杂合度较低,存在与其他品种杂交的现象,应及时建立和实施遗传资源保护策略。

关键词: 镇坪乌鸡;全基因组重测序;遗传结构;遗传多样性;遗传资源保护

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