中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (10): 173-178.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.10.022

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一株新型鹅星状病毒HNxy2111株 全基因组测序分析

董建国1,麻冰洁1,王 瑞1,芦一丹1,杨海倩1,杨大苗1,梁自怡1,王念念1,饶 丹1,焦凤超1,张 宁2,3,何书海1*   

  1. (1.信阳农林学院动物科技学院,河南信阳 464000; 2.河南牧业经济学院,河南郑州 450046; 3.河南丰源和普农牧股份有限公司,河南漯河 462000)
  • 出版日期:2024-10-15 发布日期:2024-10-15
  • 作者简介:董建国(1986-),男,博士,副教授,主要从事动物分子病毒学和免疫学研究,E-mail:dongjianguo213@163.com

  • Online:2024-10-15 Published:2024-10-15

摘要: 为分析信阳地区鹅星状病毒(GAstV)的遗传变异情况,研究从信阳某鹅场痛风 病鹅采集病料,进行病原分离鉴定和全基因组扩增测序,获得GAstV基因组,随后进行遗传进 化和同源性分析。结果显示:分离一株 GAstV,命名为 HNxy2111,基因组全长 7 175 bp; HNxy2111基因组及ORF2基因均与参考毒株G519亲缘关系最近,处于同一分支,属于GAstV-Ⅱ 型;HNxy2111 基因组、ORF1a、ORF1b 编码氨基酸序列与 GAstV-Ⅱ型中的 G519 同源性最高, 均为 99.2%。ORF1b 编码的氨基酸序列与 GD AHAU2 同源性最高,为 100%。与 G519 相比, HNxy2111 ORF1a、ORF1b和ORF2编码的蛋白质分别发生了8处、3处和5处突变。综上所述, HNxy2111 属于 GAstV-Ⅱ型,与国内经典鹅星状病毒有较近的遗传关系,ORF1a、ORF1b 和 ORF2编码的蛋白有一定的突变。

关键词: 鹅星状病毒;基因组;遗传进化分析;同源性;分离鉴定

中图分类号: