中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (6): 44-55.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.06.007

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山东、广西地区新型鹅细小病毒全基因组扩增及遗传进化分析

乔丹丹1,刘婷隽1,陈全刚1,李德宝1,周 婕1,董淑红2,胡安康1*   

  1. (1.徐州医科大学实验动物中心,江苏徐州 221004; 2.徐州生物工程职业技术学院,动物工程学院,江苏徐州 221006)
  • 出版日期:2024-06-15 发布日期:2024-06-18
  • 作者简介:乔丹丹(1993-),女,硕士,助理实验师,主要从事家禽疾病发病机制的基础研究,E-mail:525655732@qq.com

  • Online:2024-06-15 Published:2024-06-18

摘要: 为监测新型鹅细小病毒(Novel goose parvovirus,NGPV)的流行和变异情况,研究采 集了山东和广西部分地区的鸭短喙综合征病料进行病原检测、全基因组扩增及序列比对分析。 结果显示:共分离两株NGPV,山东分离株命名为SD202304,广西分离株命名为GX202304,两株 病毒与2021年NGPV分离株HNXY21亲缘关系最近,全基因组序列相似性为99.1%;GX202304 株末端重复序列(Inverted terminal repeat,ITR)有一段未见报道的51 bp基因插入;VP3编码氨基 酸序列比对显示,在第290位GX202304株和SD202304株有一个苏氨酸到丙氨酸的突变,这是 NGPV近年来发生的新变异位点。研究表明,从山东、广西地区分离到的两株NGPV存在51 bp新 的基因插入片段和VP3新的突变位点,结果为我国NGPV感染的防控提供科学依据。

关键词: 新型鹅细小病毒;全基因组序列;鸭;变异

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