中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (9): 31-37.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.09.006

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传染性法氏囊病病毒和禽致病性大肠杆菌的二重探针实时荧光定量PCR方法的建立与应用

陈金南1,陈 睿1,李尚泉1,李静玲1,陈容慧1,农芳婷1,王威威2,李宜海1,王林果3,韦 平2,何秀苗1*   

  1. (1.广西民族大学海洋与生物技术学院,广西多糖材料与改性重点实验室,广西南宁 530006;2.广西大学养禽与禽病学研究所,广西南宁 530005;3.普莱柯生物工程股份有限公司,河南洛阳 471000)
  • 出版日期:2023-09-15 发布日期:2023-09-15
  • 作者简介:陈金南(1995-),女,硕士研究生,研究方向为分子病毒学,E-mail:17776369146@163.com

  • Online:2023-09-15 Published:2023-09-15

摘要: 为建立用于传染性法氏囊病病毒(IBDV)和禽致病性大肠杆菌混合感染快速鉴别检测的实时荧光定量PCR(FQ-PCR)方法,研究分别根据IBDV VP2基因和大肠杆菌UidA基因设计合成特异性引物和探针,通过普通PCR方法扩增目的基因片段并克隆至pGM-T载体,构建重组质粒pGM-T/VP2和pGM-T/UidA作为标准品,通过正交试验确定引物和探针的最佳浓度,分别建立基于VP2和UidA基因的标准扩增曲线,并进一步验证其特异性、灵敏性、重复性,建立的方法应用于人工感染样本和临床样本的检测,并与常规PCR方法进行比较。结果显示:VP2和UidA基因的最佳上、下游引物浓度均为0.30μmol/L,VP2和UidA基因的探针浓度分别为0.35μmol/L和0.25μmol/L;VP2和UidA基因扩增的线性范围均为103~107拷贝/μL,相关系数R2≥0.99,灵敏度均为100拷贝/μL;两者组间及组内变异系数均小于2%;人工感染样品与临床样品的检测结果与普通 PCR 方法一致。研究表明,建立的二重探针 FQ-PCR 方法为同时检测IBDV和禽致病性大肠杆菌提供了快速、敏感、特异且能满足临床样本需求的检测方法。

关键词: IBDV;禽致病性大肠杆菌;混合感染;二重FQ-PCR

中图分类号: