中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (8): 24-30.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.08.004

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北京油鸡线粒体D-loop区遗传多样性及系统进化研究

张冰1,2,张剑2,晏志勋2,常枨2,耿爱莲2,王海宏2,刘华贵2,王志鹏1*,初芹2*   

  1. (1.东北农业大学动物科学技术学院,黑龙江哈尔滨150081;2.北京市农林科学院畜牧兽医研究所,北京市100097)
  • 发布日期:2023-08-11
  • 作者简介:张冰(1998-),女,硕士研究生,研究方向为动物分子数量遗传学,E-mail:1443712158@qq.com

  • Published:2023-08-11

摘要: 为了从母系遗传的角度探讨北京油鸡的遗传多样性和系统进化,研究测定了165只北京油鸡线粒体DNA(mtDNA)D-loop区全序列,分析其遗传多样性并结合NCBI下载的43个其他鸡种序列构建了系统发育树。结果显示,北京油鸡mtDNA D-loop 区全序列长度1 231~1 232 bp,存在一处碱基缺失;共发现26处单核苷酸变异位点,组成了13种单倍型;核苷酸多样性为0.004 27±0.000 74,单倍型多样性为0.563±0.047,核苷酸平均差异数为5.258;北京油鸡13 种单倍型可划分为A、B、C、E 四个分支,其中C 分支为优势分支,占检测个体的 73.3%。结果表明,北京油鸡线粒体遗传多样性呈中等水平,保种效果较好。

关键词: 北京油鸡;线粒体DNA;D-loop区;遗传多样性;系统进化

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