中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (6): 11-18.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.06.002

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GH基因SNPs与宁都黄鸡睾丸性状的关联分析

马荆鄂,许继国,姚利君,谭玉文,朱学农,杨艳北,饶友生,周 敏*   

  1. (南昌师范学院生物技术研究院, 江西省地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌 330032)
  • 发布日期:2023-06-09
  • 作者简介:马荆鄂(1987-),女,博士,副教授,主要从事家禽分子遗传育种研究,E-mail:382646281@qq.com

  • Published:2023-06-09

摘要: 为探索生长激素基因(Growth hormone,GH)部分序列单核苷酸多态位点及其单倍型对宁都黄公鸡睾丸性状的影响,寻找地方鸡种睾丸性状选育的分子标记,试验选取499只 16周龄宁都黄公鸡为研究材料,采用PCR直接测序法筛选GH基因5′-flanking和内含子1区域的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,利用 SAS(Statistical analysis system)分析睾丸性状关联的SNP位点,利用PHASE软件对多态位点进行单倍型分析,并使用在线软件对关联位点的转录因子结合类型进行预测。结果显示:GH基因上游序列存在6个多态性位点,即T1272755C、G1272611A、C1272225T、C1271211T、C1271025A和A1271024C,均对睾丸性状的影响达到显著水平(P<0.05);与睾丸性状相关的优势基因组合为 TGCCAC/TGCTAC;转录因子预测结果显示在一些转录因子的结合位点会随着等位基因变异而发生特异性变化,如 AR(Androgen receptor)、PR(Progesterone receptor)、Sox2(sex determining region Y-box 2)、SRY(Sex determining region Y)、HNF-3beta(Hepatocyte nuclear factor 3- beta)等。研究表明 C1271211T为宁都黄鸡睾丸性状的关键候选分子标记,CC基因型个体的睾丸性状显著高于TT型,推测原因为上述5种转录因子之间相互作用,调控GH表达,共同影响睾丸性状。

关键词: 宁都黄鸡;生长激素基因;单核苷酸多态位点;睾丸性状

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