基于DElncRNA-miRNA-mRNA网络化解析藏鸡低氧适应性

doi:10.16372/j.issn.1004-6364.2023.04.005

中国家禽 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (4): 25-29.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2023.04.005

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基于DElncRNA-miRNA-mRNA网络化解析藏鸡低氧适应性

张增荣^1，2，蒋小松^1，2，邱莫寒¹，余春林¹，杜华锐¹，李晴云¹，彭涵¹，熊霞¹，宋小燕¹，胡陈明¹，夏波¹，杨礼¹，陈家磊¹，杨朝武^1，2*

（1.四川省畜牧科学研究院，四川成都 610066；2.动物遗传育种四川省重点实验室，四川成都 610066）

发布日期:2023-04-14
作者简介:张增荣（1980-），男，博士，副研究员，主要从事家禽育种研究，E-mail：zhangzengrong2004@163.com

Published:2023-04-14

摘要/Abstract

摘要： 为了探讨藏鸡低氧适应机制，试验对藏鸡和大恒鸡胚胎心脏组织进行全转录组测序分析，构建了包括5个DElncRNAs、3个miRNAs、19个靶基因参与的ceRNA网络，通过实时荧光定量PCR验证5个候选lncRNAs。结果显示：ENSGALG00000050044、ENSGALG00000008047和ENSGALG00000053982在藏鸡中的表达水平显著低于大恒鸡（P<0.05），获得42条网络化通路与氧化代谢或能量代谢有关。研究表明，藏鸡对低氧的适应不是通过单一途径实现的，可能是通过协调多个miRNAs的表达变化，触发不同的靶基因和代谢途径来实现，结果为研究生物适应低氧条件提供了新的思路。

中图分类号:

S831.2

张增荣，蒋小松，邱莫寒，余春林，杜华锐，李晴云，彭涵，熊霞，宋小燕，胡陈明，夏波，杨礼，陈家磊，杨朝武. 基于DElncRNA-miRNA-mRNA网络化解析藏鸡低氧适应性[J]. 中国家禽, 2023, 45(4): 25-29.

[1]	范升鑫，李帅浩，李鸿泰，苑鹏涛，翟彬，张鸿源，谷金星，康相涛，李国喜，张彦华. 固始鸡胸肌脂肪酸组成特征及其关键调控基因鉴定[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 1-10.
[2]	马荆鄂，许继国，姚利君，谭玉文，朱学农，杨艳北，饶友生，周敏. GH基因SNPs与宁都黄鸡睾丸性状的关联分析[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 11-18.
[3]	姬改革，栾德琴，刘一帆，屠云洁，单艳菊，邹剑敏，章明，巨晓军，束婧婷. 不同品种（配套系）黄羽肉鸡皮肤毛囊密度性状发育规律[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 19-23.
[4]	毛智琼，徐桂云，全季康，刘兴利，马国明，郑传威，牛山，李春鹏，张航. 矮小型纯系蛋鸡80周龄产蛋量与蛋品质关联性分析[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 24-29.
[5]	陈楚雯，李洁，赵瑞鹏，李志雄. CRISPR/Cas9技术在鸡遗传育种中的研究进展[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 96-103.
[6]	王希彩，白露，孙嘉宏，谭晓冬，李韦，孔富丽，赵桂苹，文杰，刘冉冉. 磁珠法提取鸡血液基因组DNA效果研究[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 111-114.
[7]	潘晨曦，李璐，康国磊，李梦霄，宋杰，马腾壑，王红娜. 太行鸡INHA基因多态性与产蛋性状相关性研究[J]. 中国家禽, 2023, 45(6): 115-119.
[8]	杜永旺，黄超，王一东，蔡日春，余洋，赵桂苹，郑麦青. 金陵花鸡基因组选择效果分析[J]. 中国家禽, 0, (): 30-36.
[9]	李荣宏，杨朝武，余春林，王蓉芳，兰英花，罗金保，牟桑，苏元君，杨小林. 黑水凤尾鸡杂交组合的杂种优势分析[J]. 中国家禽, 0, (): 37-43.
[10]	杨梦园，宁中华. 鸡重要性状GWAS分析的研究进展[J]. 中国家禽, 0, (): 105-110.
[11]	魏晓冉，宋武，刘涛，燕雨蒙，燕海峰. 鸡精液稀释技术优化及其在不同种鸡场的应用研究[J]. 中国家禽, 0, (): 115-120.
[12]	张剑，曹婧，耿爱莲，王海宏，初芹，晏志勋，张小月，张尧，刘华贵. 不同日龄北京油鸡胸肌中长链脂肪酸的变化规律研究[J]. 中国家禽, 2023, 45(3): 1-7.
[13]	刘锐，李江凌，杨朝武，余春林，赵素君，王秋实，王宇萍. 鸡外周血T淋巴细胞分群及免疫相关基因表达分析[J]. 中国家禽, 2023, 45(3): 17-23.
[14]	孔少芬，罗威，郑茗，聂庆华. 中国地方品种杏花鸡的群体全基因组选择印记分析[J]. 中国家禽, 2023, 45(3): 30-37.
[15]	沈晓晖，王晓亮，蔡霞，李欣，魏晓明，周云峰，杨长锁，姚俊峰. 60~100周龄海兰粉蛋鸡产蛋性能及蛋品质研究[J]. 中国家禽, 2023, 45(3): 113-116.

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