中国家禽 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (12): 14-20.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2022.12.003

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京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析

王永丽,刘晓静,崔焕先,文 杰*   

  1. (中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,动物营养学国家重点实验室,北京 100193)
  • 发布日期:2022-12-21
  • 作者简介:王永丽(1996-),女,硕士研究生,研究方向为家禽分子营养,E-mail:13592578118@163.com

  • Published:2022-12-21

摘要: 为研究京星黄鸡肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)性状的遗传基础,研究选用十六世代IMF选择系(n=252)和对照系(n=264)群体,使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况,挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因。结果显示:选择系IMF、甘油三酯(Triglyceride,TG)、活重、屠体重等指标均显著高于对照系;XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1 099个基因,共同筛选到264个候选基因,这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关,并鉴定到ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL和PLCB1等9个脂代谢关键候选基因。研究表明,IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化,鉴定到9个脂肪代谢关键基因,并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因,为IMF遗传基础研究提供参考。

关键词: 京星黄鸡;选择信号;功能分析;候选基因;肌内脂肪

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