中国家禽 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (6): 13-20.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2022.06.003

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独龙鸡卵巢转录组分析

任宇,丁玥竹,郭爱伟,刘莉莉*   

  1. (西南林业大学生命科学学院,云南昆明 650224)
  • 发布日期:2022-06-24
  • 作者简介:任宇(1997-),女,硕士研究生,研究方向为动物遗传育种,E-mail:1908663558@qq.com

  • Published:2022-06-24

摘要: 为探索独龙鸡生产性状相关基因的调控关系,研究采集3只300日龄健康状况良好的独龙鸡卵巢组织作为试验样本,构建cDNA文库进行转录组测序,并与饲养条件和日龄相似的芦花鸡卵巢组织进行比较分析。结果显示:与芦花鸡相比,独龙鸡中平均含有416 997个SNP位点,52 458个可变剪接,共有2 903个新基因,656个差异表达基因。GO分析显示差异表达基因主要涉及核糖体结构成分、细胞因子活性、结合等过程;KEGG分析显示差异表达基因主要富集在核糖体、氧化磷酸化、TGF-β、类固醇激素生物合成通路等;qRT-PCR数据显示10个差异表达基因的上下调趋势与转录组测序结果一致。研究结果表明候选基因细胞色素P450侧链裂解酶(CYP11A1)、细胞色素 P450c17 芳香化酶(CYP17A1)、细胞分裂周期蛋白 26(CDC26)、分泌型卷曲相关蛋白4(SFRP4)可能是影响独龙鸡产蛋性能的重要候选基因,可进一步深入研究。研究结果为完善独龙鸡生产性状研究奠定了理论基础。

关键词: 独龙鸡;芦花鸡;卵巢组织;转录组测序

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