狮头鹅17β-HSD2基因SNPs位点的筛查及生物信息学分析

doi:10.16372/j.issn.1004-6364.2022.05.002

中国家禽 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (5): 8-13.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2022.05.002

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狮头鹅17β-HSD2基因SNPs位点的筛查及生物信息学分析

陈新企¹，姜平¹，周光现¹，王慧芳¹，李立先²，陈灿杰³，贾汝敏^1*，赵志辉^1*

（1.广东海洋大学滨海农业学院，广东湛江 524088； 2.饶平浮滨狮头鹅原种繁育基地有限公司，广东潮州 521000； 3.汕头市澄海区潮鹏生态养殖有限公司，广东汕头 515000）

发布日期:2022-05-18
作者简介:陈新企（1996-），女，硕士研究生，研究方向为动物遗传育种与繁殖，E-mail：2476359974@qq.com

Published:2022-05-18

摘要/Abstract

摘要： 为筛选狮头鹅17β-羟基类固醇脱氢酶Ⅱ基因（17β-HSD2）的SNPs位点并进行生物信息学分析，采用直接测序法检测17β-HSD2基因外显子5区域的SNPs位点，并利用生物信息学软件分析突变前后 mRNA 二级结构的变化。结果表明，在狮头鹅群体中共发现 6 个SNPs，仅Exon5-351 G>A为错义突变。17β-HSD2基因突变前后mRNA最小自由能（MFE）、质心二级、含有假结的mRNA二级与折叠结构，均发生变化，且MFE自由能上升，结构稳定性变弱。结果可为后续探究17β-HSD2基因对狮头鹅繁殖性状的影响机制提供基础数据。

中图分类号:

S835

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