中国家禽 ›› 2021, Vol. 43 ›› Issue (12): 7-13.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2021.12.002

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利用转录组测序筛选鸡繁殖性状 相关lncRNAs

李春苗1,2*,贾雪波1*,黄正洋1,2,黎寿丰1,2,黄华云1,2,王钱保1,2,薛龙岗1,赵振华1,2**   

  1. (1.江苏省家禽科学研究所,江苏扬州225125; 2.江苏省家禽遗传育种重点实验室,江苏扬州225125)
  • 发布日期:2021-12-24
  • 作者简介:李春苗(1982-),女,硕士,副研究员,主要从事优质肉鸡遗传育种研究,E-mail:cherrylcm@163.com;贾雪波(1979-),男,硕士, 副研究员,主要从事家禽疫病防控研究,E-mail:312215753@qq.com

  • Published:2021-12-24

摘要: 为探讨长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)在鸡繁殖性状中的作 用,研究通过分析苏禽3号高产组和低产组母鸡垂体转录组数据,结合edgeR软件预测出在鸡 垂体中差异表达的lncRNA,并通过GO和KEGG pathway富集分析,找出与鸡繁殖性状相关的 差异表达lncRNA。结果表明,通过预测得到952个差异表达的lncRNA,其中908个上调,44个 下调;差异表达的lncRNA 共富集到9 个信号通路,与繁殖性状相关的通路分别为BMP 和 cAMP,共筛选到3个与繁殖性状相关的lncRNA,推测这3个lncRNA在鸡繁殖过程中起重要作 用,但其机制还需要进一步研究。研究结果对进一步深入研究与鸡产蛋性能相关的lncRNA 生物学功能及调控机制奠定了基础,丰富了鸡的生殖调控理论。

关键词: 转录组;鸡;垂体;lncRNA

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