摘要： 利用简化基因组SNPs数据分析徐海鸡及周边地方鸡种遗传多样性，为徐海鸡的 保护和利用提供支持。收集徐海鸡等13个地方鸡种血液样品，提取基因组DNA，应用简化基 因组测序技术进行SNP分型，获取群体遗传学参数，并以邻接法、最大似然法、贝叶斯法构建 系统进化树。结果显示：徐海鸡基因组SNPs观测杂合度为0.18，期望杂合度为0.28，在受试地 方鸡种中品种内遗传多样性属于中等程度。Mantel测试表明遗传距离与地理距离呈现正相关 （P<0.05）。系统进化树显示多数地方鸡种间存在明显界限。研究表明：徐海鸡独立成枝，与其 它地方鸡种存在遗传上差别；地方鸡种之间存在有限的基因流；与最大似然法、贝叶斯法相 比，邻接法更适合利用简化基因组数据构建系统进化树。

关键词: 地方鸡；遗传多样性；GBS测序；Mantel测试；系统进化树

中图分类号: 

• S831.2