摘要： 为了解上海市优质地方品种浦东鸡的保种效果，采用“京芯一号”SNP芯片对现有 60个家系的浦东鸡群体进行了群体结构分析。结果显示：浦东鸡群体的基因型检出率平均为 0.9914，说明该SNP芯片适用于浦东鸡遗传多样性的评价与分析；浦东鸡群体期望杂合度为 0.3786、观察杂合度为0.3805，说明该群体的遗传多样性较低，选育程度较高；G矩阵基因组亲 缘关系表明，该群体存在近交趋势；ROH分析结果显示，群体中含有23~28个ROH的个体数最 多，个体ROH总长度在70~80 Mb内的个体数最多，该群体平均近交系数为0.089；根据聚类分 析，将120只公鸡划分为38个家系，并将180个母鸡划分入不同家系，其中F52_3号母鸡与所 有公鸡亲缘系数均小于0.1，将其归入“其他”分类中。综上，建议在今后的浦东鸡配种选留 工作中：① 同一家系的公母鸡避免配种；② F52_3号母鸡可与任一只公鸡配种；③ 注意3、11、 26、27、38家系的选留，避免造成优良家系丢失。

关键词: SNP芯片；浦东鸡；保种；遗传多样性；选种选配

中图分类号: 

• S831.2