中国家禽 ›› 2020, Vol. 42 ›› Issue (4): 97-102.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2020.04.018

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广东鹅源圆环病毒分子流行病学调查 与毒株遗传进化分析

陈济铛1,2,陈 冈2,牛 森1,朱婉君2,张溢珊2,刘敏芳2,陈建红1,2,张济培1,2*   

  1. (1.佛山科学技术学院,广东佛山 528225; 2.佛山万牧洲生物科技有限公司,广东佛山 528225)
  • 发布日期:2021-12-02
  • 作者简介:陈济铛(1986-),男,博士,讲师,研究方向为水禽传染病防治方向,E-mail:jidangchen@fosu.edu.cn

  • Published:2021-12-02

摘要: 为了解广东地区圆环病毒在鹅群中的流行情况。研究针对鹅圆环病毒全基因组 保守序列设计特异性检测引物,采用PCR方法对送检的232份鹅疑似鹅圆环病毒感染病例进 行检测。并针对其中一份阳性样品病毒全基因组进行测序,获得该毒株全基因组序列信息。 对该毒株全基因进行遗传进化分析、Cap蛋白相似性分析和B细胞抗原表位预测。结果显示, 232份样品中阳性检出率为44.4%,表明鹅圆环病毒在广东地区鹅群中普遍存在,鹅圆环病毒 毒株与其他已报道的鹅源毒株处于同一遗传进化分支,鹅源毒株间Cap蛋白相似性为98.0%~ 100%,但与鸭圆环病毒相似性低(46.9%~48.2%);Cap蛋白B细胞线性表位预测结果提示,鹅 源和鸭源毒株表位位置相近,但氨基酸序列差异较大,提示两种毒株之间交叉保护力可能存 在差异。研究为了解广东地区鹅源圆环病毒流行、进化情况,并进一步做好相关防控工作提 供理论参考。

关键词: 鹅圆环病毒;PCR检测;流行病学;遗传进化

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