产蛋和停产武定鸡卵巢转录组SNP分析

doi:10.16372/j.issn.1004-6364.2020.03.002

中国家禽 ›› 2020, Vol. 42 ›› Issue (3): 8-12.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2020.03.002

产蛋和停产武定鸡卵巢转录组SNP分析

吴梦，杨明，马琳，叶绍辉^*

（云南农业大学动物科学与技术学院，云南昆明 650201）

发布日期:2021-12-02
作者简介:吴梦（1996-），女，硕士研究生，研究方向为动物遗传育种，E-mail：1060603470@qq.com

Published:2021-12-02

摘要/Abstract

摘要： 为提高武定鸡生产性能，探索繁殖相关差异基因，对270日龄产蛋和停产一周以上的武定鸡卵巢组织进行转录组测序，将获得的数据进行SNP检测，利用GO富集和KEGG富集分析 SNP 所在基因。结果显示：产蛋武定鸡特有的 SNP 有 116 235 个，停产武定鸡特有的 SNP有156 020个，两者共有的SNP有276 467个；GO富集分析发现，SNP所在基因大量富集在生物进程中；KEGG富集分析发现，SNP所在基因显著富集在代谢途径、剪接、细胞周期、细胞凋亡、基础转录因子等通路；对GnRH信号通路中的5个基因SNP分析发现，有9个SNP位于外显子区，其中有4个SNP位于编码区并引起了氨基酸的改变。研究结果为武定鸡繁殖性能的相关研究提供了理论依据。

中图分类号:

S831.2

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