中国家禽 ›› 2020, Vol. 42 ›› Issue (1): 116-120.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2020.01.024

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藏鸡基因组微卫星特征分析

郭新颖,张 健,李梦柔,段梦琪,严飞飞,李雨晴,王世伟,强巴央宗,商 鹏*   

  1. (西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝 860000)
  • 发布日期:2021-12-01
  • 作者简介:郭新颖(1993-),女,硕士,主要从事动物遗传与育种方面的研究,E-mail:15774315018@163.com

  • Published:2021-12-01

摘要: 藏鸡为我国高原特有地方品种,为了保护其地方品种资源,开发高原特色产业, 本研究采用MISA软件检测藏鸡全基因组序列中存在的微卫星位点,并找出其SSR开始分析。 研究结果发现:共找到411 761个微卫星序列,含微卫星的序列共14 295条,微卫星平均每隔 2 607.56 kb出现一个序列,其中1 055种重复基元模式在藏鸡DNA序列中被找到,所占比例份 额最高的是(TA)n(47.49%),10~15 bp的是微卫星序列长度所在的主要区域。因此,藏鸡微卫 星标记的开发利用为藏鸡品种的分子鉴定打下基础,可以加快藏鸡杂交选育进程,以便获得 较好的开发前景和产生巨大的经济效益。

关键词: 藏鸡;微卫星;基因组

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